心房顫動依發作持續時間的長短，約可分為三類：48小時內會自行恢復的是陣發性心房顫動；持續超過1周是持續性心房顫動；如果持續發作，沒有辦法在短時間內恢復，就是屬於永久性的心房顫動。

一般而言，陣發性心房顫動、持續性心房顫動會優先考慮藥物治療。永久性心房顫動，若藥物控制不好可與主治醫師討論是否要運用侵入性的微創手術，像是電燒來減緩心房顫動的發作頻率、左心耳封堵器來降低中風的風險。

藥物治療的目標有二大類：一是服用心律藥來控制心跳的節律，二是服用抗凝血劑來降低中風的發生。

在中風預防上，則可藉由風險評估量表（CHA2DS2-VASc score）來評估心房顫動發作時中風的風險度，決定是否要服用抗凝血劑。

CHA2DS2-VASc的分數，從0分到9分，若男性若≥2分、女性≥3分，建議可與主治醫師討論是否要持續服用抗凝血劑來預防中風。